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1)  Subtractive hybridization differential display(SHDD)
消减杂交差异显示分析
2)  mRNA differential display(mRNA DD)
mRNA差异显示分析
3)  differential display
差异显示分析
1.
The mRNA differential display was adopted to analyze the differences of gene expression in murineerythroleukemia cells before and after chemical-induced eothroid differentiation.
以六个锚定引物和六个随机引物共36种组合进行差异显示分析,得到67个差异片段。
2.
In the paper,Cd tolerant alfalfa varieties in were selected among 36 alfalfa germplasms using hrdroponics system,then cadmium-induced oxidation resistance and photosythentic responses were analyzed in cd tolerant varieties Ye(Y) and Longzhong(LZ),and alfalfa metallothionein gene MsMT2a and MsMT2b were cloned using mRNA differential display method.
)种质材料进行抗镉性筛选试验,对获得的抗镉苜蓿品种进行CdCl_2胁迫条件下的生理生化响应研究,并进一步利用mRNA差异显示分析方法克隆紫花苜蓿金属硫蛋白(metallothionein,MTs)基因MsMT2a和MsMT2b,结果如下:1)选用0、5、10、15、20、25、50和100 mg/L的CdCl_2浓度梯度进行抗镉性筛选研究,确定适宜的CdCl_2筛选浓度为25 mg/L,进一步利用水培法对25 mg/LCdCl_2处理和对照条件下的苜蓿幼苗进行培养,分析比较紫花苜蓿种质材料在胁迫处理和对照条件下根长、茎长、根生物量和茎生物量参数的变化发现,根相对生长量是适宜的衡量紫花苜蓿镉耐受性的参数。
4)  digital differential display
数字化差异显示分析
1.
In silico cloning and digital differential display analysis of Danio rerio QM gene by EST database searching;
表达序列标签数据库搜索克隆斑马鱼QM基因及其数字化差异显示分析
5)  representational difference analysis (RDA)
表达性差异显示分析(RDA)
6)  hybridization-monitored differential analysis
杂交监控差异分析法
1.
The principles, applicability and compare of their advantages and disadvantages of several analytic methods on the genic differences, especially a new method called hybridization-monitored differential analysis, HMDA were briefly reviewed in this paper.
本文简述了几种近年来常用的筛选差异基因的方法,特别是最新发表的杂交监控差异分析法(HMDA)的原理、适用范围及其特点,重点探讨了HMDA法在真核基因组差异序列筛选中的技术性突破及其研究前景。
补充资料:表达谱差异分析

表达谱差异分析(differential expression profiling)主要包括基因表达谱(gene expression profiling) 和蛋白质表达谱(protein expression profiling) 。大规模表达谱分析已经成为认识疾病分子机制的有利方法,在癌症研究等方面取得了一定的进展。成功的表达谱分析基于实验及其过程分析的有机结合。实验过程从关注的疾病开始,首先收集大量的疾病相关组织样本,样本数量可从10 多个到数百个,但必须足以对每一组织类型及个体差异进行比较分析,而且许多情况下不能仅简单地分为正常和疾病组织。例如,在对糖尿病的研究中,所收集的样本来自健康人、胰岛素耐受和糖尿病病人的不同试验阶段,如胰岛素治疗前后。样品还应包括其他器官的取材,以便进行基因表达的组织分布研究。为了便于对后来的实验数据进行分析管理,需采集并储存所有的组织样本和临床参数。接下来进行组织样本的处理,利用生物芯片(寡核苷酸芯片、cdna 芯片或全基因组芯片) 进行表达谱测定,并进行生物信息学分析。

通常,表达谱的分析结果需进一步的实验加以证实。定量rt2pcr 是最灵敏的确证方法,该方法还可以将确证实验的范围扩大到原测组织以外的更广泛的组织和组织类型,揭示基因表达的组织分布情况。

确证实验揭示了疾病相关基因。据此,可以进行进一步研究,探索这些基因的功能,开发新的治疗手段。例如,对于正常和疾病组织中表达有显著性变化的基因,可以进行新治疗靶点的鉴定和确定研究,或利用实验和分析工具研究分析其功能;对于疾病组织中活性升高的酶,可以当作前药活化酶进行鉴定研究。典型的表达谱能够显示疾病过程中有大量的已知基因表达的改变,而许多已知基因的代谢通路、表达产物酶学分类和蛋白质功能业已发表,将两者对照分析,可以鉴定出酶活性,选择其中可能成为前药活化酶的部分进行进一步研究;对于疾病特异的蛋白质,可以进行抗原表型分析,决定疫苗的开发策略。

寻找差异表达基因的方法除芯片技术外,一些新的检测方法如差异显示pcr ( differential display pcr, dd-pcr) 、消减杂交( suppression subreactive hy bridization , ssh) 等也相继得到结合应用。

说明:补充资料仅用于学习参考,请勿用于其它任何用途。
参考词条