哈尔滨市医药工程学校是市教育局直属的全日制普通中等专业学校。学校的前身为哈尔滨市建筑材料工业学校,1987年１２月建校，1988年正式面向全国招生。1989年与哈尔滨市建材工业技工学校合并，形成普通中专、技校和行业培训的多功能办学单位。2004年１２月经省教育厅批准，学校更名为哈尔滨市医药工程学校，2005年1月学校归属哈尔滨市教委。学校主要办学宗旨是立足为北药服务为振兴老工业基地建设服务，培养医药、城市建设行业中等职业及技能人才，广泛开展行业培训和劳动力转移培训。

学校实行封闭管理，治学严谨，办学特色鲜明，师资雄厚（高级讲师、讲师达95%）。学校现代化教学设施完备，有微机室、电脑组装与维修实验室、生化实验室、微生物实验室、药物化学实验室、药物分析实验室，中药展室等各类实验室；设有电子图书室、阅览室、语音室、图书馆等，并且学校开设闭路电视系统和信息管理网络系统，可网络教学和互联网教学。

学校的培养目标是培养有实践技能的高素质的应用型技术人才。开办有三个骨干专业群：以制药工程为核心的药学专业群，以工民建和装饰装修为核心的城市建设专业群，以计算机及电子商务为核心的计算机专业群。现开设专业有制药工程、药品营销、制药设备安装与维修、计算机网络、电子商务（医药方向）等十几个专业，其中电脑艺术设计、建筑装饰、工业与民用建筑、硅酸盐工艺及工业控制等专业的部分学生专业课阶段在北京建材学校学习实践，并可在北京就业。学校开设就业指导中心，与全国各大中城市建立用人供需网，多年来为社会输送了大批的高素质的职业技能人才，深受社会用人单位的欢迎，毕业生每年一次性就业率达95%。