该校创建于1959年，是巴中市首批重点中学。

学校占地61亩，建筑面积52020平方米。近年来，学校大力改善办学条件，加快硬件建设，建成了全市一流的教学实验综合大楼、学生公寓、学生食堂和综合运动场；装备了标准的语音室、微机室和多媒体教室；开通了校园宽带网、闭路电视网，可实现现代信息技术教学。如今的巴中二中，已成为莘莘学子接受优质教育的殿堂。

学校坚持"以人为本、全面发展"的办学理念，构建了"重高、普高、艺高"整体发展的办学体制；"全员聘任、竞争上岗"的激励机制；"集体备课、资源共享"的教学教研机制；"任务到班、责任到人"的目标管理机制;"突出重点、打造精品"的分层教学机制，力求为每一位学生成人、成才找到最佳发展空间，教育教学质量连年攀升。2003、2004年高考本科分别上线226人和326人，位居市级重点中学第一。学校先后为清华、复旦、人大等著名高等学府输送了大批合格新生。先后有20多人留学英、日、美、法、德、韩、加拿大等国，有16人已获得博士学位，曾被省教厅中教处誉为"大巴山飞出的金凤凰"。